我目前正在开发一个基于R Markdown和Shiny的用户界面,以便让不熟悉R的其他用户能够轻松执行机器学习训练过程。这个训练过程是由一个围绕R包mxnet的自定义函数完成的,并通过message()
函数直接向控制台提供状态更新,如训练错误或加载的包信息,当在“普通”R脚本中运行时。然而,当在R Markdown中运行此应用程序时,浏览器中不会显示任何内容。以下脚本展示了一个最小的可重现示例(其中训练过程被一个简单的“虚拟”函数替代):
---title: "Training of a Neural Network"output: html_documentruntime: shiny---```{r setup, include=FALSE}knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)``````{r start_training, echo=F}inputPanel( actionButton("button_start_training", "Start training"))``````{r dummy_function, echo=F}dummy_function <- function(){ for(i in 1:5){ message(paste0("Test: "),i) Sys.sleep(0.5) }}``````{r actual_training, echo=F}event_training = eventReactive(input$button_start_training,{ dummy_function()})renderPrint({ event_training() })```
dummy_function()
的控制台输出不会显示在浏览器中,而只会在控制台中显示。如果将message()
替换为print()
,结果中确实会显示内容,但仅在函数完成之后显示,而不是“实时”显示。因为实际的训练过程需要几个小时,我希望能够像在控制台中那样实时提供这些更新。此外,将message()
替换为print()
可能会引起一些问题,因为像训练错误这样的信息是在mxnet训练过程中作为消息返回的,而不是作为打印输出(如果我理解正确的话)。
因此,这归结为两个问题:
- 有没有办法让
renderPrint()
一出现就立即打印输出? - 有没有办法让
renderPrint()
使用message()
生成的输出,而不是print()
?
感谢您的帮助。
回答:
一种解决方案是将withCallingHandlers
与shinyjs
包结合使用(https://github.com/daattali/shinyjs)。使用这种方法,您可以更改页面上元素的内部HTML,这会立即显示。从一个空元素开始,每次函数调用message
时,您可以向元素添加一个日志,如下所示:
dummy_function <- function(){ for(i in 1:5){ message(paste0("Test: "),i) Sys.sleep(0.5) }runApp(shinyApp( ui = fluidPage( shinyjs::useShinyjs(), actionButton("button_start_training", "Start training"), textOutput("logs") ), server = function(input, output, session) { observeEvent(input$button_start_training, { withCallingHandlers({ shinyjs::html("logs", "") dummy_function() }, message = function(m) { shinyjs::html(id = "logs", html = m$message, add = TRUE) }) }) }))