应用主成分分析并保留总方差的百分比

我想对特定数据集进行主成分分析,然后将主成分输入到LogisticRegression分类器中。

具体来说,我想应用PCA并保留90%的总方差,使用函数computePrincipalComponentsAndExplainedVariance

以下是读取数据集的代码:

// 加载数据val text = sparkSession.sparkContext.textFile("dataset.data")        val data = text.map(line => line.split(',').map(_.toDouble))  // 分离标签和特征val dataLP = data.map(t => (t(57), Vectors.dense(t.take(57)))) 

我不太确定如何进行PCA以保持90%的总方差。


回答:

使用computePrincipalComponentsAndExplainedVariance函数,返回值将是一个矩阵以及一个包含每个主成分解释的方差值的向量。根据文档

返回值:一个大小为n-by-k的矩阵,其列为主成分,以及一个指示每个主成分解释的方差值的向量

通过使用足够大的k作为输入,你可以简单地将向量中的数字相加,直到达到90%或以上,然后使用矩阵中相应数量的列。

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