我在尝试理解以下情况：

1. 当我创建新的xgbost DMatrix

   xgX = xgb.DMatrix(X, label=Y, missing=np.nan)

2. 基于输入数据X，它有64个特征

3. 我得到了新的DMatrix，它有55个特征

这里发生了什么魔法？任何建议都会非常有帮助！

回答：

看看xgboost issue #1223

在那儿，khotilov发表了评论：

使用CSR的问题在于，当你有完全稀疏的列在末尾时，仅通过查看CSR的索引和指针，你无法发现它们的存在。

这样做的后果是，创建DMatrix的函数XGDMatrixCreateFromCSR并未考虑末尾的空列，在你的情况下是9列。你可能需要检查一下你的情况，并确定X中是否真的有64个特征。