为什么那个代码片段无法在Google Colab上运行?

我使用了提供35 GB内存的TPU。在尝试运行这个代码片段之前,我有20 GB的可用内存。但由于内存不足(提示需要超过35 GB),我无法运行那个代码片段。我使用了一个6 GB的数据集。为什么这个代码占用了那么多空间?我使用了垃圾回收器并删除了之前使用的dataframe。我能做些什么来让这个代码运行起来呢?

可用内存:26.4 GB | 进程大小:156.4 MBGPU 可用内存:16280MB | 使用量:0MB | 使用率 0% | 总量 16280MB

seed = 7test_size = 0.4X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, Y, test_size=test_size)gc.collect()model=KNeighborsClassifier(n_neighbors=6,algorithm='kd_tree',n_jobs=25)model.fit(X_train, y_train)

回答:

在Python中,数据科学的工作流程通常非常耗费内存。例如,如果你的输入数据X, Y消耗了6GB,那么这行代码

X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, Y, test_size=test_size)

将消耗另外6 GB(每个创建的子集不是原始数组的视图,而是一个具有新内存占用的新数组对象)。

KNeighborsClassifier内部,可能会制作数据的其他副本(例如,该算法中的代码要求输入数组是连续的C-ordered float64数组,如果你的数据不符合这一标准,将会制作一个副本)。

一般来说,基于numpy的数据科学工作流程的一个好经验法则是,你需要大约4-5倍于你所处理的原始数据大小的内存,除非你非常小心地防止数据复制。

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