首先，我构建了一个模型，通过以下代码：

cf1 <- cforest(y~., data = DATA, strata = DATA$y,           ntree = 200L, mtry = 10)

考虑到数据集非常不平衡（y=1 占全部观察值的7%），所以我在这里添加了 strata，确保在装袋过程中不会忽略 y=1 的观察值。 cf1 在混淆矩阵方面运行正常。然而，当我尝试通过以下代码进行特征选择时：

cf1.imp_cond <- varimp(cf1, conditional = TRUE)

它返回了以下错误：

Error in x[strata == s] <- .resample(x[strata == s]) : NAs are not allowed in subscripted assignments

我无法理解这个错误的含义。之前有人遇到过这个问题吗？

—-更新

这是我从原始数据集中处理后的测试数据。以下是代码：

cf2 <- cforest(X5_years_survival~., data = test, strata = X5_years_survival,           ntree = 200L, mtry = 6)cf2.imp_cond <- varimp(cf2, conditional = TRUE)

仍然，我得到了同样的错误：

Error in x[strata == s] <- .resample(x[strata == s]) : NAs are not allowed in subscripted assignments

—更新

错误发生在应用 kidids_node 函数时。

回答：

事实上，如果我保持所有 integer 类型的协变量，而不是通过 as.factor 转换它们，使用 varimp 就不会出现错误。