Sklearn中的非负矩阵分解

我正在对一个大型矩阵应用非负矩阵分解(NMF)。NMF方法的基本操作如下:给定一个m行n列的矩阵A,NMF将其分解为A = WH,其中W是m行d列的矩阵,H是d行n列的矩阵。Python包Sklearn中实现了ProjectedGradientNMF方法。我希望算法能同时返回W和H。但似乎它只返回H,而不返回W。对A的转置矩阵A.T再次应用该算法可以得到W。然而,由于矩阵非常大,我希望避免进行两次计算。

如果你能告诉我如何同时获得W和H,那就太好了!以下是我的代码:

from sklearn.decomposition import ProjectedGradientNMFimport numpyA = numpy.random.uniform(size = [40, 30])nmf_model = ProjectedGradientNMF(n_components = 5, init='random', random_state=0)nmf_model.fit(A)H = nmf_model.components_.T

回答:

幸运的是,你可以查看源代码:
https://github.com/scikit-learn/scikit-learn/blob/master/sklearn/decomposition/nmf.py

fit_transform()从第460行开始,在第530行显示H被附加到components_上,而W从函数中返回。

所以你不需要运行两次,你只需要将:

nmf_model.fit(A);H = nmf_model.components_.T;

改为:

W = nmf_model.fit_transform(A);H = nmf_model.components_;

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