使用mRMRe进行分类目标变量的特征选择

我正在尝试使用R语言中的mRMRe包对基因表达数据集进行特征选择。

我的目标变量是一个分类变量,即每个样本都与一个类别相关联,并用作目标变量。

然而,当我使用mRMRe包尝试加载数据时,遇到了以下错误:

data <- mRMR.data(data = data)Error in .local(.Object, ...): data columns must be either of numeric, ordered factor or Surv typeTraceback:1. mRMR.data(data = data)2. new("mRMRe.Data", ...)3. initialize(value, ...)4. initialize(value, ...)5. .local(.Object, ...)6. stop("data columns must be either of numeric, ordered factor or Surv type")

第一列包含分类标签,例如“Class1”、“Class2”等。当我使用str(data)时,我发现第一列是Factor类型。然而,由于它是分类变量,因此无法排序。

是否可能mRMRe无法处理分类数据?


回答:

我从开发者那里得到了答复:

目标变量只有在有序的情况下才可以是分类变量。对于只有两个类别的情况,顺序是任意的。对于更多类别且逻辑上无序的多类别分类,mRMRe不适用。

所以在这种情况下,我无法使用它,因为我的标签是分类变量。

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