使用逻辑回归和Iris数据集计算ROC AUC得分

我需要做的是:

  • 应用逻辑回归分类器
  • 使用AUC报告每个类的ROC
  • 使用逻辑回归的估计概率来指导ROC的构建
  • 对模型训练使用5倍交叉验证

为此,我的方法是使用这个非常好的教程:

基于他的想法和方法,我只是改变了获取原始数据的方式,像这样:

df = pd.read_csv(    filepath_or_buffer='https://archive.ics.uci.edu/ml/machine-learning-databases/iris/iris.data',     header=None,     sep=',')df.columns=['sepal_len', 'sepal_wid', 'petal_len', 'petal_wid', 'class']df.dropna(how="all", inplace=True) # drops the empty line at file-enddf.tail()# split data table into data X and class labels yX = df.iloc[:,0:4].valuesY = df.iloc[:,4].values

然后我直接运行代码。如果我尝试使用accuracy
balanced_accuracy等指标,一切正常(即使是许多其他指标)。我的问题是当我尝试使用roc_auc指标时,我得到了以下错误:

“ValueError: Only one class present in y_true. ROC AUC score is not defined in that case.”

这个错误已经在这里1, 这里2, 这里3, 和 这里4讨论过。然而,我无法使用他们提供的任何“解决方案”/变通方法来解决我的问题。

我的完整代码是:


回答:

Iris数据集通常是按类别排序的。因此,当你不打乱顺序进行分割时,测试数据集可能会只包含一个类别。

一个简单的解决方案是使用shuffle参数。

kfold = model_selection.KFold(n_splits=10, shuffle=True, random_state=seed)

即便如此,roc_auc也不直接支持多类格式(Iris数据集有三个类别)。

请通过这个链接了解更多关于如何在多类情况下使用roc_auc的信息。

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