Scikit-learn KDTree query_radius 同时返回 count 和 ind?

我试图同时返回count(邻居的数量)和ind(这些邻居的索引),但除非我调用两次query_radius,否则无法实现。尽管这在计算上很密集,但实际上在 Python 中对我来说比遍历ind并计算每行的尺寸更快!这似乎非常低效,所以我想知道是否有办法在一个调用中返回它们?

我尝试在调用query_radius后访问treecountind对象,但它们不存在。在 numpy 中没有有效的方法来做到这一点,对吗?

>>> array = np.array([[1,2,3], [2,3,4], [6,2,3]])>>> tree = KDTree(array)>>> neighbors = tree.query_radius(array, 1)>>> tree.indTraceback (most recent call last):  File "<stdin>", line 1, in <module>AttributeError: 'sklearn.neighbors.kd_tree.KDTree' object has no attribute 'ind'>>> tree.countTraceback (most recent call last):  File "<stdin>", line 1, in <module>AttributeError: 'sklearn.neighbors.kd_tree.KDTree' object has no attribute 'count'

回答:

考虑以下数据集:

array = np.random.random((10**5, 3))*10tree = KDTree(array)

正如你在问题中指出的,有三种选择:

1) 调用两次tree.query_radius来获取邻居及其数量。

neighbors = tree.query_radius(array, 1)counts = tree.query_radius(array, 1, count_only=1)

这需要8.347秒。

2) 仅获取邻居,然后通过遍历它们来获取数量:

neighbors = tree.query_radius(array, 1)counts = []for i in range(len(neighbors)):    counts.append(len(neighbors[i]))

这比第一种方法显著快,耗时4.697秒

3) 现在,我们可以改进计算counts的循环时间。

neighbors = tree.query_radius(array, 1)len_array = np.frompyfunc(len, 1, 1)counts = len_array(neighbors)

这是最快的,耗时4.449秒。

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