Scikit-learn: GridSearchCV中的评分

看起来scikit-learn的GridSearchCV会收集其(内部)交叉验证折叠的得分,然后对所有折叠的得分进行平均。我对这种做法背后的原理感到好奇。乍一看,似乎更灵活的做法是收集其交叉验证折叠的预测,然后对所有折叠的预测应用所选的评分指标。

我之所以注意到这个问题,是因为我在一个不平衡的数据集上使用GridSearchCV,设置了cv=LeaveOneOut()scoring='balanced_accuracy'(scikit-learn v0.20.dev0)。将像平衡准确率(或召回率)这样的评分指标应用于每个留出的样本似乎没有意义。相反,我希望先收集所有预测,然后一次性对所有预测应用我的评分指标。或者,这种推理是否存在错误?

更新:我通过创建一个基于GridSearchCV的自定义网格搜索类解决了这个问题,区别在于首先从所有内部折叠中收集预测,然后一次性应用评分指标。


回答:

GridSearchCV使用评分来决定模型中应设置哪些内部超参数。

如果你想估计“最优”超参数的性能,你需要进行额外的交叉验证步骤。

参见http://scikit-learn.org/stable/auto_examples/model_selection/plot_nested_cross_validation_iris.html

编辑以更接近回答实际问题:对我来说,如果你想使用LeaveOneOutbalanced_accuracy,收集每个折叠的预测然后对它们进行评分似乎是合理的。我认为你需要创建自己的网格搜索器来做到这一点。你可以使用model_selection.ParameterGridmodel_selection.KFold来实现。

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