看起来R语言是设计用来处理可以完全加载到内存中的数据集的。对于无法完全加载到内存中的超大数据集的信号处理和机器学习,有哪些推荐的R包?
如果R语言不适合处理这种情况,我愿意接受其他免费且强大的建议(例如,如果有处理超大数据集的良好方法,可以考虑scipy)。
回答:
请查看CRAN上高性能计算任务视图中的“超大内存和内存外数据”子部分。 bigmemory 和 ff 是两个受欢迎的包。对于bigmemory(以及相关的 biganalytics 和 bigtabulate),bigmemory网站上有Jay Emerson提供的几个非常好的演示、简介和概述。对于ff,我推荐阅读Adler Oehlschlägel及其同事的优秀幻灯片演示,位于ff网站上。
此外,请考虑将数据存储在数据库中,并以较小的批次读取进行分析。可能有许多方法需要考虑。开始时,可以查看biglm包中的一些示例,以及Thomas Lumley的此演示。
还请调查高性能计算任务视图上提到的其他包以及其他回答中提到的包。我上面提到的包只是我碰巧有更多经验的包。