Python中出现MemoryError而IPython中没有

一般来说,你能想到为什么会发生这种情况吗?(即在Python中出现MemoryError,而在IPython(控制台,不是笔记本)中没有?)

更具体地说,我在使用sklearn的sgdclassifier,在multiclassmultilabel情况下。它在以下代码中报错:

model = SGDClassifier(    loss='hinge',     penalty='l2',     n_iter=niter,     alpha=alpha,     fit_intercept=True,    n_jobs=1)mc = OneVsRestClassifier(model)mc.fit(X, y)

在调用mc.fit(X, y)时,出现以下错误:

 File "train12-3b.py", line 411, in buildmodel    mc.fit(X, y)  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/sklearn/multiclass.py", line 201, in fit    n_jobs=self.n_jobs)  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/sklearn/multiclass.py", line 88, in fit_ovr    Y = lb.fit_transform(y)  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/sklearn/base.py", line 408, in fit_transform    return self.fit(X, **fit_params).transform(X)  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/sklearn/preprocessing/label.py", line 272, in transform    neg_label=self.neg_label)  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/sklearn/preprocessing/label.py", line 394, in label_binarize    Y = np.zeros((len(y), len(classes)), dtype=np.int)MemoryError

Y是一个有600万行的矩阵和k列,其中金标准标签为1,其余为0(在这种情况下,k = 21,但我想超过2000)。即使Y是以稀疏形式传入的,sklearn也会将其转换为密集矩阵(因此Y = np.zeros((len(y), len(classes)), dtype=np.int)导致MemoryError)。

我有60 GB的内存,对于21列来说,最多不应超过8 GB(600万 * 21 * 64),所以我很困惑。我将Y = np.zeros((len(y), len(classes)), dtype=np.int改为使用dtype = bool,但没有效果。

有什么想法吗?


回答:

听起来你遇到了当前标签二值化器实现的限制:请参见问题#2441。有一个PR #2458来修复这个问题。

请随时尝试那个分支,并将你的结果作为评论报告给那个PR。

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