我有以下代码:
model_nn <- train( Y ~ ., training, method = "nnet", metric = "ROC", trControl = trainControl( method = "cv", number = 10, verboseIter = TRUE, classProbs = TRUE, summaryFunction = twoClassSummary ))nnprediction <- predict(model_nn, testing)cmnn <-confusionMatrix(nnprediction,testing$Y)print(cmnn)
代码可以正常运行。然而,我无法通过confusionMatrix命令评估ROC指标的表现。我应该如何评估它,以便尝试不同的变量集和/或机器学习算法来提升ROC性能?
附注:因变量是一个两类的因子。
回答:
只需输入model_nn
,就可以得到训练过程中不同设置的AUC得分;这里是一个例子,使用iris
数据的前100条记录(2类):
library(caret)library(nnet)data(iris)iris_reduced <- iris[1:100,]iris_reduced <- droplevels(iris_reduced, "virginica")model_nn <- train( Species ~ ., iris_reduced, method = "nnet", metric = "ROC", trControl = trainControl( method = "cv", number = 5, verboseIter = TRUE, classProbs = TRUE, summaryFunction = twoClassSummary ))model_nn
结果:
神经网络 100个样本 4个预测变量 2个类别: 'setosa', 'versicolor' 无预处理重抽样: 交叉验证(5折) 样本大小总结: 80, 80, 80, 80, 80 跨调参的重抽样结果: size decay ROC Sens Spec 1 0e+00 1.0 1.0 1 1 1e-04 0.8 0.8 1 1 1e-01 1.0 1.0 1 3 0e+00 1.0 1.0 1 3 1e-04 1.0 1.0 1 3 1e-01 1.0 1.0 1 5 0e+00 1.0 1.0 1 5 1e-04 1.0 1.0 1 5 1e-01 1.0 1.0 1 使用最大的值选择最优模型时使用了ROC。模型的最终值为size = 1和decay = 0.1。
顺便说一下,这里提到的“ROC”术语有些误导:返回的当然不是ROC(ROC是一条曲线,而不是一个数字),而是ROC曲线下的面积,即AUC(在trainControl
中使用metric='AUC'
有相同的效果)。