PCA先进行还是标准化先进行?

在进行回归或分类时,预处理数据的正确(或更好的)方法是什么?

  1. 标准化数据 -> PCA -> 训练
  2. PCA -> 标准化PCA输出 -> 训练
  3. 标准化数据 -> PCA -> 标准化PCA输出 -> 训练

以上哪一种方法更正确,或者是预处理数据的“标准化”方式?这里的“标准化”指的是标准化、线性缩放或其他技术。


回答:

在进行PCA之前,你应该先标准化数据。例如,考虑以下情况。我创建了一个数据集X,它有一个已知的相关系数矩阵C

>> C = [1 0.5; 0.5 1];>> A = chol(rho);>> X = randn(100,2) * A;

如果我现在执行PCA,我正确地发现主成分(权重向量的行)与坐标轴成角度:

>> wts=pca(X)wts =    0.6659    0.7461   -0.7461    0.6659

如果我现在将数据集的第一个特征缩放100倍,直觉上我们认为主成分不应该改变:

>> Y = X;>> Y(:,1) = 100 * Y(:,1);

然而,我们现在发现主成分与坐标轴对齐:

>> wts=pca(Y)wts =    1.0000    0.0056   -0.0056    1.0000

为了解决这个问题,有两个选项。首先,我可以重新缩放数据:

>> Ynorm = bsxfun(@rdivide,Y,std(Y))

(奇怪的bsxfun符号用于在Matlab中进行向量-矩阵运算 – 我所做的只是减去每个特征的均值并除以其标准差)。

我们现在从PCA中得到了合理的结果:

>> wts = pca(Ynorm)wts =   -0.7125   -0.7016    0.7016   -0.7125

它们与原始数据的PCA略有不同,因为我们现在保证了我们的特征具有单位标准差,这在最初不是这样的。

另一个选项是使用数据的相关系数矩阵而不是外积来执行PCA:

>> wts = pca(Y,'corr')wts =    0.7071    0.7071   -0.7071    0.7071

事实上,这完全等同于通过减去均值然后除以标准差来标准化数据。只是这样做更方便。在我看来,除非你有充分的理由不这样做(例如,如果你想要捕捉到每个特征变化的差异),否则你应该始终这样做。

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