我正在尝试将如何在PyMC中建模3个正态分布的混合?中定义的高斯混合模型移植到pymc3中
代码
import numpy as npfrom pymc import Model, Gamma, Normal, Dirichletfrom pymc import Multinomialfrom pymc import sample, Metropolisk = 3ndata = 500v = np.random.randint(0, k, ndata)data = ((v == 0)*(50 + np.random.randn(ndata)) + (v == 1)*(-50 + np.random.randn(ndata)) + (v == 2)*np.random.randn(ndata))model = Model()with model: dd = Dirichlet('dd', k=k, a=1, shape=k) precs = Gamma('precs', alpha=0.1, beta=0.1, shape=k) means = Normal('means', 0, 0.001, shape=k) category = Multinomial('category', n=1, p=dd, shape=ndata) points = Normal('obs', means[category], precs[category], observed=data) tr = sample(3000, step=Metropolis())
我遇到了以下代码错误:
AttributeError: <pymc.quickclass.Multinomial object at 0x4804210> has no default value to use, checked for: ['mode'] pass testval argument or provide one of these.
我做错了什么?
回答:
这是因为模型中的变量没有传递初始值。通常这不是问题,因为模型会使用每个分布的均值/中位数/众数作为初始值。多项分布比较棘手,因为均值通常会给出支持范围之外的值(即非整数值),而众数的计算也很困难。
短期解决方案是至少为多项分布提供初始值。我将在错误跟踪系统中提交一个问题,以确定长期应该采取什么措施。