根据组别分隔训练集和测试集

我有一个如下所示的样本数据:

import pandas as pddf = pd.DataFrame({"x": [10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 110, 120],                   "id": [1, 1, 1, 1, 2, 2, 3, 3, 4, 4, 5, 5],                   "label": ["a", "a", "a", "b", "a", "b", "b", "b", "a", "b", "a", "b"]})

所以我的数据看起来像这样

  x   id   label 10   1    a 20   1    a 30   1    a 40   1    b 50   2    a 60   2    b 70   3    a 80   3    a 90   4    b100   4    a110   5    b120   5    a

我想根据标签分布将这些数据分成两个组(训练集和测试集),给定测试样本的数量(例如6个样本)。我的设置更喜欢将测试集的大小定义为表示测试样本数量的整数,而不是百分比。然而,在我的特定领域中,任何id必须只分配到一个组中。例如,如果id 1被分配到训练集,其他带有id 1的样本不能被分配到测试集。因此,预期的输出是如下的两个数据框:

训练集

  x   id   label 10   1    a 20   1    a 30   1    a 40   1    b 50   2    a 60   2    b

测试集

  x   id   label 70   3    a 80   3    a 90   4    b100   4    a110   5    b120   5    a

训练集和测试集具有相同的类别分布(a:b是4:2),id 1和2只被分配到训练集,而id 3、4、5只被分配到测试集。我曾经使用sklearn的train_test_split来处理,但我不确定如何在这种条件下应用它。您能提供一些处理这种情况的建议吗?


回答:

sklearn.model_selection除了train_test_split之外还有其他几个选项。其中一个选项旨在解决您所追求的目标。在这种情况下,您可以使用GroupShuffleSplit,正如文档中提到的,它提供随机的训练/测试索引来根据第三方提供的组别分割数据。对于这种情况,您还可以使用GroupKFold,它非常有用。

from sklearn.model_selection import GroupShuffleSplitX = df.drop('label',1)y=df.label

现在您可以实例化GroupShuffleSplit,并像使用train_test_split一样操作,唯一的区别是指定一个group列,该列将用于根据组别值分割Xy:

gs = GroupShuffleSplit(n_splits=2, test_size=.6, random_state=0)train_ix, test_ix = next(gs.split(X, y, groups=X.id))

现在您可以索引数据框来创建训练集和测试集:

X_train = X.loc[train_ix]y_train = y.loc[train_ix]X_test = X.loc[test_ix]y_test = y.loc[test_ix]

结果如下:

print(X_train)      x  id4    50   25    60   28    90   49   100   410  110   511  120   5

而测试集为:

print(X_test)   x  id0  10   11  20   12  30   13  40   16  70   37  80   3

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