以下是一个极度简化的DataFrame,代表包含医疗诊断的更大DataFrame:
medicalData = pd.DataFrame({'diagnosis':['positive','positive','negative','negative','positive','negative','negative','negative','negative','negative']})medicalData diagnosis0 positive1 positive2 negative3 negative4 positive5 negative6 negative7 negative8 negative9 negative
问题:为了机器学习,我需要随机将这个数据框拆分为三个子数据框,如下方式:
trainingDF, validationDF, testDF = SplitData(medicalData,fractions = [0.6,0.2,0.2])
…其中拆分数组指定了完整数据中分配到每个子数据框的比例。
- 子数据框中的数据需要是互斥的,并且拆分数组(比例)需要总和为1。
- 此外,每个子集中的阳性诊断比例需要大致相同。
- 这个问题的答案建议使用pandas的sample方法或sklearn的train_test_split函数。但这些解决方案似乎都不能很好地泛化到n次拆分,且没有提供分层拆分的方案。
回答:
np.array_split
如果你想要泛化到n
次拆分,np.array_split
是你最好的朋友(它与DataFrame兼容得很好)。
fractions = np.array([0.6, 0.2, 0.2])# 打乱你的输入df = df.sample(frac=1) # 分成3部分train, val, test = np.array_split( df, (fractions[:-1].cumsum() * len(df)).astype(int))
train_test_split
使用train_test_split
进行分层拆分的复杂解决方案。
y = df.pop('diagnosis').to_frame()X = df
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split( X, y,stratify=y, test_size=0.4)X_test, X_val, y_test, y_val = train_test_split( X_test, y_test, stratify=y_test, test_size=0.5)
其中X
是你特征的DataFrame,y
是你标签的单列DataFrame。