我试图在每个质心周围画一个圆,圆的半径延伸到每个聚类中最远的点。现在我的圆的半径是延伸到整个训练数据集中离聚类中心最远的点。
这是我的代码:
def KMeansModel(n): pca = PCA(n_components=2) reduced_train_data = pca.fit_transform(train_data) KM = KMeans(n_clusters=n) KM.fit(reduced_train_data) plt.plot(reduced_train_data[:, 0], reduced_train_data[:, 1], 'k.', markersize=2) centroids = KM.cluster_centers_ # 以红色X标记质心 plt.scatter(centroids[:, 0], centroids[:, 1], marker='x', color='r') for i in centroids: print np.max(metrics.pairwise_distances(i, reduced_train_data)) plt.gca().add_artist(plt.Circle(i, np.max(metrics.pairwise_distances(i, reduced_train_data)), fill=False)) plt.show()out = [KMeansModel(n) for n in np.arange(1,16,1)]
回答:
当你执行
metrics.pairwise_distances(i, reduced_train_data)
你计算的是所有训练点的距离,而不是仅计算相关类别的训练点的距离。为了找到训练数据中对应类别ind
的点的索引,你可以这样做
np.where(KM.labels_==ind)[0]
因此,在for循环中
for i in centroids:
你需要访问特定类别的训练点。这样做可以解决问题:
from sklearn.decomposition import PCAfrom sklearn.cluster import KMeansfrom sklearn import metricsimport matplotlib.pyplot as pltimport numpy as npdef KMeansModel(n): pca = PCA(n_components=2) reduced_train_data = pca.fit_transform(train_data) KM = KMeans(n_clusters=n) KM.fit(reduced_train_data) plt.plot(reduced_train_data[:, 0], reduced_train_data[:, 1], 'k.', markersize=2) centroids = KM.cluster_centers_ # 以红色X标记质心 plt.scatter(centroids[:, 0], centroids[:, 1], marker='x', color='r') for ind,i in enumerate(centroids): class_inds=np.where(KM.labels_==ind)[0] max_dist=np.max(metrics.pairwise_distances(i, reduced_train_data[class_inds])) print(max_dist) plt.gca().add_artist(plt.Circle(i, max_dist, fill=False)) plt.show()out = [KMeansModel(n) for n in np.arange(1,16,1)]
这是我使用上述代码得到的一个图形: