从Dask数据框中获取一行而不将整个数据框加载到内存中

是否可以让Dask一次只将一行加载到内存中?我有一个巨大的200GB数据集,我希望Dask能够在给定索引的情况下一次检索一行。然后我想从该行获取numpy数组。当我尝试调用以下代码时:

df_row = df.loc[index]df_row = df_row.values.compute()

Dask试图将整个数据框加载到内存中,而不是只加载一小行。如果我不调用compute而只调用values,那么df_row仍然是一个dask.array对象。这似乎应该有一个显而易见的解决方案,因为这是一个非常常见且简单的用例。我做错了什么?


回答:

如果Dask能够在不加载数据的情况下知道每个分区中索引的开始和结束值(称为“分区”),并且这些分区形成单调递增的序列,那么Dask就不会加载所有行。

例如,parquet数据类型通常会在元数据中存储列的最大/最小值,因此如果数据按合理顺序排序,那么.loc[]确实只会加载包含数据的那个分区。

然而,对于像CSV这样的数据格式,在不解析和考虑所有数据的情况下,不可能知道某个分区是否包含与请求对应的索引值。

您可能对重新分区或在数据上明确设置索引感兴趣,或者,如果您独立知道这些值,可以在尝试.loc操作之前提供分区的值。

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