我在尝试在 sparklyr 中创建模型矩阵。有一个函数 ml_create_dummy_variables()
可以一次为一个分类变量创建虚拟变量。据我所知,没有像 model.matrix() 那样一次性创建模型矩阵的等效函数。使用 ml_create_dummy_variables()
很简单,但我不知道为什么新的虚拟变量没有存储在 Spark 数据框中。
考虑以下示例:
### 创建虚拟数据以了解在 sparklyr 中模型矩阵公式的工作原理
v1 <- sample( LETTERS[1:4], 50000, replace=TRUE, prob=c(0.1, 0.2, 0.65, 0.05))
v2 <- sample( LETTERS[5:6], 50000, replace=TRUE, prob=c(0.7,0.3))
v3 <- sample( LETTERS[7:10], 50000, replace=TRUE, prob=c(0.3, 0.2, 0.4, 0.1))
v4 <- sample( LETTERS[11:15], 50000, replace=TRUE, prob=c(0.1, 0.1, 0.3, 0.05,.45))
v5 <- sample( LETTERS[16:17], 50000, replace=TRUE, prob=c(0.4,0.6))
v6 <- sample( LETTERS[18:21], 50000, replace=TRUE, prob=c(0.1, 0.1, 0.65, 0.15))
v7 <- sample( LETTERS[22:26], 50000, replace=TRUE, prob=c(0.1, 0.2, 0.65, 0.03,.02))
v8 <- rnorm(n=50000,mean=.5,sd=.1)
v9 <- rnorm(n=50000,mean=5,sd=3)
v10 <- rnorm(n=50000,mean=3,sd=.5)
response <- rnorm(n=50000,mean=10,sd=2)
dat <- data.frame(v1,v2,v3,v4,v5,v6,v7,v8,v9,v10,response)
write.csv(dat,file='fake_dat.csv',row.names = FALSE)
# 将 "fake_dat.csv" 推送到 hdfs
library(dplyr)
library(sparklyr)
# 配置 Spark 会话并连接
config <- spark_config()
config$`sparklyr.shell.driver-memory` <- "2G" # 根据数据大小进行调整
config$`sparklyr.shell.executor-memory` <- "2G"
sc <- spark_connect(master='yarn-client', spark_home='/usr/hdp/2.5.0.0-1245/spark',config = config)
sc
# 也可以将 spark_home 设置为 ‘/usr/hdp/current/spark-client’
# 从 hdfs 读取数据
df <- spark_read_csv(sc,name='fdat',path='hdfs://pnhadoop/user/stc004/fake_dat.csv')
# 创建 Spark 表
dat <- tbl(sc,'fdat')
# 创建虚拟变量
ml_create_dummy_variables(x=dat,'v1', reference = NULL)
现在我从 sparklyr 得到以下通知:
Source: query [5e+04 x 15]
Database: spark connection master=yarn-client app=sparklyr local=FALSE
v1 v2 v3 v4 v5 v6 v7 v8 v9 v10
<chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <dbl> <dbl> <dbl>
1 A F I O Q T X 0.4518162 12.281566 3.915094
2 C E H L Q T X 0.3967605 2.131341 3.373347
3 C F I O P S W 0.4458047 7.167670 2.737003
4 C E G M P T X 0.4822457 5.946978 2.375309
5 B E H L P U W 0.4756011 9.456327 2.406996
6 C F H L P U X 0.5064916 2.920591 3.111827
7 C F I O Q T W 0.3060585 1.611517 2.242328
8 B F J L Q T V 0.6238052 9.821750 2.670400
9 C E I O Q U X 0.4249922 2.141794 3.020958
10 B F G K P T X 0.5348334 1.461034 3.057635
# ... with 4.999e+04 more rows, and 5 more variables: response <dbl>,
# v1_A <dbl>, v1_B <dbl>, v1_C <dbl>, v1_D <dbl>
当我检查列数时,新的虚拟变量并没有出现。
> colnames(dat)
[1] "v1" "v2" "v3" "v4" "v5" "v6"
[7] "v7" "v8" "v9" "v10" "response"
>
为什么会这样?此外,有没有一种简单的方法可以一次性转换所有列?我处理的数据集有超过1000个变量,所以我需要一种快速的方法来做这件事。我尝试过创建循环,但那没有任何效果:
for(i in 1:7){
ml_create_dummy_variables(x=dat,colnames(dat)[i],reference=NULL)
}
回答:
ml_create_dummy_variables
不会修改现有表,而是创建新表,你的代码只是丢弃了结果。你需要存储结果:
tmp <- ml_create_dummy_variables(x=dat,'v1', reference = NULL)
此外,有没有一种简单的方法可以一次性转换所有列?我处理的数据集有超过1000个变量,所以我需要一种快速的方法来做这件事
使用循环或 Reduce
函数是可以的,但没有快速的方法来实现。为了创建虚拟变量,你必须首先[确定所有可能的水平,这需要对每个变量进行完整的列扫描。
此外,对于超过1000列的数据集,尤其是当水平数很多时,你会开始遇到Spark优化器的不同限制。sparklyr
(与使用Vector
UDT的Spark ML不同)会展开所有列,这种方法扩展性不佳。