我使用Scikit learn的pipeline对象是因为我有一系列任务需要执行(上采样、特征选择、分类)。我的上采样方法是定制的,这意味着我必须为pipeline实现一个自定义转换器。
一个转换器必须有transform和fit方法。当然,我只想对训练数据进行上采样,而不对测试数据进行上采样。这是否意味着我只需要实现fit方法,而不需要实现transform方法(对传入fit方法的数据集进行上采样)?据我所知,transform方法会同时应用于训练集和测试集…
回答:
scikit-learn的转换器不能改变样本数量,这是API不支持的 – 请参见http://scikit-learn.org/stable/modules/generated/sklearn.base.TransformerMixin.html#sklearn.base.TransformerMixin.fit_transform – 注意X、y和X_new的维度。另外,请注意它们只返回X,不返回y – 这意味着如果您改变了X的维度,它将不再与y的维度匹配。
一种方法是将其运行在pipeline之外 – 为训练生成新样本并将其放入pipeline中,而不为测试生成新样本。但这在交叉验证时将不起作用。
为了使其在交叉验证和模型选择中工作,您需要一个支持改变n_samples的转换器的自定义Pipeline类。例如,可以在imbalanced-learn包中找到一个实现:参见这里。检查这个包 – 如果您需要上采样,那么您的上采样方法可能已经在imbalanced-learn中实现了。