我有一个Java应用程序，需要执行偏最小二乘回归（PLSR）。似乎没有Java实现的PLSR。Weka可能曾经有过类似的功能，但现在已不在API中。另一方面，我找到了一个不错的R实现，并且还有额外的好处。使用这个实现的人正是我想要复制的研究结果的作者，这意味着由于PLSR实现方式的差异而导致问题的可能性较小。

问题是：有没有一个足够好且易于使用的包，可以让Java调用R，传递一些参数给函数并读取结果？我的另一个选择是让Java启动一个R进程，然后监控它。数据将通过磁盘读写。您推荐哪种方法？我是否忽略了明显的第三种选择？

回答：

我过去成功使用过两种替代方案。

JRI

• 优点：可能有更好的性能。
• 缺点：需要配置一些环境变量和库，在Windows和UNIX上有所不同。

RServe

• 优点：易于设置，不需要初始化R或链接到任何R库，可以在不同的机器上运行。
• 缺点：基于TCP/IP（运行一个服务器），不能从R进行回调。

其他我从未使用过的替代方案：RCaller