奇怪的聚类输出(scikitlean kmeans)

我有一个总共有四个标签的不平衡数据集,其中两个标签的出现频率远高于另外两个。我有近一百万个观察数据。

我试图通过使用sklearn.cluster.kmeans聚类来更好地理解数据成分。

这是我的数据:

print(X)[[68.  0.  0. ...  0.  0.  0.] [18.  1.  1. ...  1.  0.  0.] [18.  1.  1. ...  0.  0.  0.] ... [59.  0.  0. ...  0.  0.  0.] [48.  1.  0. ...  0.  0.  1.] [47.  1.  1. ...  0.  0.  0.]]print(y)[1 2 3 ... 3 2 3]

观察到的标签有四个级别(序数变量0 – 3)。

这是我的代码:

scaler = StandardScaler()scaler.fit(X)X_scaled = scaler.transform(X)algo1 = KMeans(n_clusters = 4)y_pred = algo1.fit_predict(X_scaled)mglearn.discrete_scatter(X_scaled[:, 0], X_scaled[:,1], y_pred)plt.legend(["cluster 0", "cluster 1", "cluster 2", "cluster 3"], loc = 'best')plt.xlabel("Feature 0")plt.ylabel("Feature 1")

四个聚类

这看起来很奇怪,所以我尝试了3个聚类。

algo2 = KMeans(n_clusters = 3)y_pred2 = algo2.fit_predict(X_scaled)mglearn.discrete_scatter(X_scaled[:, 0], X_scaled[:,1], y_pred2)plt.legend(["cluster 0", "cluster 1", "cluster 2"], loc = 'best')plt.xlabel("Feature 0")plt.ylabel("Feature 1")

三个聚类

然后是2个聚类

algo3 = KMeans(n_clusters = 2)y_pred3 = algo3.fit_predict(X_scaled)mglearn.discrete_scatter(X_scaled[:, 0], X_scaled[:,1], y_pred3)plt.legend(["cluster 0", "cluster 1", "cluster 2"], loc = 'best')plt.xlabel("Feature 0")plt.ylabel("Feature 1")

两个聚类

我试图弄清楚聚类到底发生了什么。是否有其他方法可以更好地理解数据结构?


回答:

你没有提到你有多少个特征,但从外观上看,X显然不止两个变量。在你的代码中,你只用两个特征来可视化聚类,而algo1使用了更多的变量。

特别是,你用Feature 1来可视化聚类,它看起来是二元的(只取值-1和1),所以聚类并不是不成功;你只是在非常有限的特征下可视化聚类。

通过二维绘图,你只能看到两个变量的聚类关系,因此你可能会错过一些只有在三维或更高维度下才可见的关系。如果你希望继续这样做,我建议你将Feature 1与所有其他特征进行绘制,然后是Feature 2与所有其他特征,以此类推。这样,你可以可视化所有大小为二的组合下的聚类,这或许能帮助你理解某些特征对及其所属聚类之间的关系。

还要记住,KMeans是一种无监督算法,因此聚类不一定与y中的标签相关。结果仅表示每个聚类中的观察数据在距离质心方面彼此相似。

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