我在使用Keras的top k分类准确率指标时遇到了问题。我正在训练基因组数据,数据包括大约10,000个个体,每个个体有4,000个核苷酸,每个核苷酸可以是四种碱基之一,因此它们被独热编码。输出类似,但不是四种碱基,而是三种类别。
输入形状 (10000, 4000, 4) 输出形状 (10000, 4000, 3)
我尝试使用top k分类准确率,但得到了以下错误:ValueError: Shape must be rank 2 but is rank 3 for ‘metrics/top_k_categorical_accuracy/in_top_k/InTopKV2’ (op: ‘InTopKV2’) with input shapes: [?,?,3], [?,?], [].
显然,Keras不喜欢3D张量。我该如何解决这个问题?
回答:
这个可能会帮助你。
简单来说,top k分类准确率的定义在维度上并不灵活。
你需要转换数据以适应这个指标。
import keras.backend as K def my_top_k(true, pred, num): true = K.reshape(true, (-1, features_num)) pred = K.reshape(pred, (-1, features_num)) return top_k_categorical_accuracy(true, pred, k=num)