R: 来自pROC包的AUC

我最近发现了pROC包，用于获取AUC。在帮助部分，他们给出了以下示例：

library("pROC")data(aSAH)auc(aSAH$outcome, aSAH$s100b)

在上述代码中，outcome是一个factor类型，而s100b是numerical类型。

我的问题是，在这种情况下AUC是如何工作的？它对s100b应用了什么阈值？还是说阈值并不重要？

编辑1上述代码结果显示AUC = 0.73。我如何知道选择了哪个阈值来得到这个值？

回答：

pROC包中的auc函数中的AUC是ROC曲线下的面积。幕后，该函数首先调用了roc函数，因此你所做的相当于：

myroc <- roc(aSAH$outcome, aSAH$s100b)auc(myroc)

ROC曲线是通过计算所有可能阈值的敏感性和特异性得到的。你可以使用plot函数来可视化这条曲线，并以灰色显示AUC：

plot(myroc, auc.polygon=TRUE)

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