为什么主成分分析(PCA)在保留的总方差较小时仍然表现良好?

我在Kaggle上通过查看其他人的内核来学习机器学习,特别是这个蘑菇分类内核。作者首先对转换后的指示矩阵应用了PCA。他只使用了2个主成分用于后续的可视化。然后我检查了它保留了多少方差,发现只保留了16%的方差。

in [18]: pca.explained_variance_ratio_.cumsum()out[18]: array([0.09412961, 0.16600686])

但是测试结果显示90%的准确率表明它表现良好。我的问题是,如果方差代表信息,那么当丢失了如此多的信息时,机器学习模型如何能表现良好?


回答:

你应该注意,原始向量空间中的许多变量是稀疏编码的分类变量。PCA并不适合处理这样的变量,并且你所参考的代码中的处理方式是不推荐的。

现在你可能会问:为什么它最初能工作?为什么仅用两个变量就行?问问自己:如果我告诉你蘑菇的颜色是红色并且有菌褶(lamella),你能判断出蘑菇是否有毒吗?如果你对蘑菇有一定的了解,那么是的,在绝大多数情况下你都能判断出来。这就是这里的算法所做的。虽然解释的方差并不多,因为有很多变量,其中一些最有意义的变量,比如颜色,是稀疏编码的,因此对PCA来说有效地分布在许多变量中。

另外,我不会说它表现得很好,而可视化图正好显示了这一点。考虑这张显示逻辑回归测试集结果的图片:logreg

根据测试结果,它有90%的准确率。当你看它时,你认为它表现得好吗?在左下角,有一团可食用和有毒的蘑菇混在一起。显然,在这个地方,我们计算的两个特征是不够的;红菇是红色且可食用的。

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